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75% of people globally want unbiased news (Pew Research) but are concerned they're not getting that.

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PODCAST

NeuroRadio

米国シアトル・ボストン在住の神経科学者2人によるポッドキャスト。最新の研究論文紹介や基礎科学・医学研究に関する(あるいは全く関係しない)雑談、留学情報など。感想やコメント、質問などはtwitterハッシュタグ #NeuroRadio あるいはinfoあっとneuroradio.tokyoまで。

science life sciences

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01:45:01

#62 Beyond predictions - Part 1

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2023/09/09

Sainsbury Wellcome Centreの古館昌平さん(@ShoheiFurutachi, e-mail) ゲスト回、雑談メインの前編。留学時に分野を大きく変えた動機とそれに伴う苦労、PI（TomとSonja）のスタイル、SWCの雰囲気やロンドン生活について伺いました（9/2 収録） Show Notes (番組HP): 古館さん Prediction-Errorに関する最新プレプリント Tomラボ Sonjaラボバイオステーションポッドキャスト続編 (先にこちらから聴くことを推奨) Jan Gründemann 長谷川さん Thalamusやってる Rippleとか David Foster的な Tim Behrens的な Loren Frank的な Sam Gershman Matthew Botvinick Kim Stachenfeld の仕事 Nelson Spruston Mesoscope (2P-RAM)でとった仕事動画 NeuroPixels 2.0 の 4-shank

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01:55:15

#61 August Green

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2023/09/02

一時帰国とオフ会、オフィスのデスク削減方法、総合誌に載るマニアックな論文談義。論文紹介は、磁場によるタンパク質の蛍光強度調節、マウスの眼優位性カラム？、新タイプの近赤外Caセンサー、等 (8/27 収録) Show Notes (番組HP): オフ会：#NeuroRadioオフ会検査のspecificityと言ってしまってますが、陽性的中率が正しい Hoteling desk HHKB 白/無刻印 Grubhub: ウーバーイーツみたいなものマイナスのチップ AwatramaniとDombeckのドパミンサブタイプ論文 in NN のプレプリント版を読んだNR回 Sabatini (弟) のN Nicolas TritschのN 論文紹介パートその１：Magnetic control of GFP-like fluorescent proteins Calico Maria Ingaramo Andrew York リボフラビン、FAD、FMN FlavinTag 鳥の磁場感知 by ErCRY4

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01:36:24

#60 Minds Meet Weeds - Part 2

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2023/07/18

登達也さん(@nobolly, @tnobo_ktcs)ゲスト回、後編。Cell-type談義、あったら嬉しいツール談義、Assistant Features エディター経験、ジョブハント、新しく開くラボについて。(6/22収録) Show Notes (番組HP): 青葉市子その１その２その３その４ユザーンとのコラボコーネリアスと坂本慎太郎とのコラボユザーンと環ROYと鎮座ドープネスのコラボ STUTS w/ 松たか子 PUMPEE Cell Typeについて議論したNR中島さん回ドーナツが浮いてるマップ Single Action Potentialをdetectするマウス Medullaのdissection by Jean Legallois その１その２ pre-Bötzingerの同定 Cell TypeとCell Stateの違い in 植物例えば細胞周期葉っぱの表と裏でEpidermisのマーカー遺伝子が違う隣の所長(Hong-kui Zeng)が書いたレビュー U WashのJay

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02:46:54

#59 Minds Meet Weeds - Part 1

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2023/07/11

Salk Institute のEckerラボで宿主-微生物相互作用研究とゲノミクス技術開発を行っており、来年夏からイギリスのThe Sainsbury Laboratoryで独立予定の登達也さん(@nobolly, @tnobo_ktcs)がゲスト。植物を研究対象としたきっかけ、マックスプランクでのPhD3部作、ポスドクでの3部作の解説、近年のSpatial Transcriptomics技術開発トレンドに関するディスカッション。後半に続く (6/22収録) Show Notes (番組HP): 登さんHP NRのトランスクリプトーム回 EP4 EP5 Eckerラボオンライントークその１その２その３ (おすすめby登) 津田ラボ（現華中農業大学大学）津田先生放射線植物生理学研究室セシウム蓄積に関する研究その１その２その３フランス政府の給費留学留学したフランス原子力庁のラボ Max-Planck Institute for Plant Breeding Research Köln (Cologne) ケルシュ

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02:02:40

#58 Not necessarily necessary

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2023/06/30

ラボマネ・プロマネ事情、クラウドでのデータ管理・解析、マウス/キーボード談義。論文紹介は、AAV搭載可能な最小プロモーター、AAVのBBB通過に関与する受容体の同定、高所恐怖症の回路、嗅内皮質活動の回転対称性の変化、必要十分の不必要性、について (6/25収録) Show Notes (番組HP): Jimさん BICCNのNatureの1st AWSのS3 Code Ocean DataJoint Andreas Tolias DeepLabCutのMathisのとこ Data Joint使ってるラボ一覧 Logitech MX Master 3S LogitechのVertical MacのMagic Mouse TrackPad 40%のErgoのキーボード、Cornelius (一体型) Rebuild.fmの人も40% (Atreus) について話した回セパレートのやつ(Corne) 今使ってる75% Keychron K2 Pro 60%配列、たとえばPolaris Appleの指紋認証キーボード

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04:11:58

#57 Voltage imaging: a “holy grail” of neuroscience

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2023/05/24

Pieribone + Chen の in vivo 膜電位イメージング論文を題材に、遺伝学的膜電位センサー(GEVI)、広視野+高速２光子顕微鏡、U-Netベースのノイズ除去手法について掘り下げました (4/30収録) Show Notes (完全版)： Allen Institute for Neural Dynamics の SAC クラカウア―のアンチreductionistペーパー題材とした論文：High-speed low-light in vivo two-photon voltage imaging of large neuronal populations Vincent Pieribone Jerry Chenラボ GEVIパート黎明期のプローブ FlaSh (Siegel and Isacoff 1997) SPARC (Ataka and Pieribone 2002) VSFP1 from Knopfelラボ (Sakai et al.)

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02:25:34

#56 Formerly a battle-field postdoc

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2023/05/13

理研BDR宮道ラボの田坂元一さん aka 戦場ポスドクさんがゲスト。Adiラボ＠ヘブライ大学での仕事の背景、イスラエルでの生活、最新プレプリントのディスカッション (5/8 収録) Show Notes: 田坂元一さん最近の子育て学習におけるSMT→OFC→VTA回路の働きを報告したプレプリント宮道ラボ戦場ポスドク – エルサレム通信掲載号根岸ラボ紹介 Adi MizrahiラボコペンハーゲンのFENS 2016 遭遇したテロ Small GTPaseの軸索伸張に対する影響を調べた大学院でのお仕事 Carl Petersen lab KomiyamaさんのNature Paper Georg Keller, Mismatch Neuronの発見 Awakeのin vivo targeted patch clamp recording from Petersenラボ Johannes LetzkusのDisinhibition論文 Patrick Kanold lab (現JHU) 2010 Nat

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03:18:19

#55 And Your Mouse Can Sing

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2023/04/15

NYUでResearch Associate, 秋から米国PhDコースの藤島悠貴さん(@yfujishima_) がゲスト。RA応募時のこと、現在行っているSinging Mouseの研究、PhDアプリケーション全敗から２年間のRAを経てオファー大量獲得へと至った経緯、思考プロセス、得たノウハウ等を伺いました (4/5収録) Show Notes: 藤島さんHP PhDアプリケーションについてのブログ記事 by 藤島さん RAアプリケーションのブログ記事 by 藤島さん Michael Longラボ Darcy Kellyラボ NYUのRAプログラム Max Planck FloridaのRAプログラム Kevin Spencer Joseph LeDouxの本, 例えばThe Emotioal Brain GREいらなくね？の記事 Alston’s Singing Mouse (Scotinomys teguina) の解説 Michale Fee ラボ 2019年に出た始めてのSinging Mouse論文 (pdf) UT

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03:00:37

#54 It takes two

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2023/03/08

納税フラグ回収、同僚とのバックカントリー、Ben Barres自伝、フリーアドレスについて雑談。論文紹介は、学習時の場所表象変化、Disynaptic specificity、ConVERGD、非モデル生物Caイメージング、発達期の心臓の相転移、など (2/25収録) Show Notes: AIBSのイメージングディレクター、Jack Waters Kaspar Podgorski iGluSnFr3 カスパーのブログ滑落はニュースにもなってる友人の友人が紹介してたブログ記事１報目：The formation of an expanding memory representation in the hippocampus Adam CohenのところでAll-optical physiology ２報目：Disynaptic specificity of serial information flow for conditioned fear Stuberとか Kay Tyeがやり始めた”projection target

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02:50:05

#53 Understanding by creating is all you need

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2023/02/25

シンガポール、南洋理工大学の牧野さん(@Hiroshi_Makino_)がゲスト。UCSD交換留学、CSHLでのPhD時代とUCSDでのポスドク時代、シンガポールの研究環境、独立後に行っているAIと脳の表象比較研究について伺いました（2/14収録） Show Notes 牧野ラボ (Fred) Gage ラボ＠Salk Rusty: Fred Gageのこと田代ラボ Roberto Malinowラボ Krishna Shenoy PhD時代の仕事１ PhD時代の仕事２ Komiyamaラボ Yang Danラボ小宮山さんラボでの１報目 Top-downコントロール from Yang Danラボ小宮山さんが始めたAwakeでの記録小宮山さんのとこでの２報目の仕事 Chris Niellラボが始めた仕事 DeepMindが出したDQN論文 Demis Hassabis UC Berkeley のコース YouTubeで見れる単著論文（直近の方）前の論文（独立後一報め）

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02:24:04

#52 My Favorite Things

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2023/01/25

新年のんびり雑談回。一時帰国の時に行きたい店、アメリカ来てから買ってよかったもの紹介、グリーンカード申請の様子、タックスリターンの混乱など。(1/20収録) Show Notes: Rebuildの缶の音の回 (引き続きここで詳細が議論されている笑) ルスツ学会 Francesco Ferraguti Lab Csicsvari オーストリアだけどクロスターノイブルクでした雪崩講習会(日本雪崩捜索救助協議会) えびそば一幻北菓楼【きたかろう】だし茶漬けえん成田店 (臨時休業中) ミンガスコーヒー (札幌・大通り) 混んでる時は6Fにある系列店のローチロースターに行くといいです。なぜか混んでなく、こちらは豆売りもしてる La Cuisine de KAWAMURA (旧グリル・カワムラ) (福岡・薬院) 季節ごとにメニューが変わるので福岡に住んでたら年4回行きたいお店。基本なんでも大変美味しく、冬の厚岸の牡蠣、夏にデザートで出る桃とクローブのスープ等、忘れられない皿が幾つも。スペシャリテの山芋フォアグラ・マデイラソースも絶品なので是非田奈部

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02:56:24

#51 A precise tagging of active neurons

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2023/01/17

Hyungbae Kwonラボの長濱健一郎さん(@k_hammer_1001)ゲスト回。初期研修から基礎研究に進んだ経緯、狩野研でのスライスパッチャー生活、Hyungbae Kwonラボの現在の方向性、最近のST Cal-Light論文（光受容とCa2+活動による細胞の遺伝学的ラベリング手法のアップデート版）について伺いました。 Show Notes: 長濱さん最近のST-Cal Light論文光とCaのアンドゲートロジックによるラベリングその１Cal-Light from Kwonラボその２ FLARE from Alice Tingラボ Hyungbae KwonラボHP 狩野ラボHP この論文＝狩野研時代のSetd1a論文（注：収録時にはmentionできなかったのですが、ChIP-seqの実験・解析、RNA-seqの解析では東大薬・分子生物学・後藤研にいらした岸先生（岸雄介 (Yusuke Kishi) - マイポータル - researchmap）に大変お世話になりました。あと、ChR2-tdTomato→ChR2-mOrangeでした。by

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02:20:59

#50 Gestalt principles

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2022/12/02

久々のSfN参加、初Thanksgiving、Twitterからの移行に関する雑談。論文紹介は、カリウム選択的チャネルロドプシンの構造、魚の脳発達は氏か育ちか、プルダウンアッセイと機械学習によるAAVの指向進化、など (11/26収録) Show Notes: 萩氏のアブストラクト Jeremiah Joshua Trachtenberg 古館昌平氏ヨーロッパは運転免許証のExpireが無い：国によって違うらしい。スイスは無い、ドイツは10-15年？ GRABでペプチドのセンサー Rebuildのエピソード Twitter上での繋がりを保存するツールフラッシュ論文論文１：Structural basis for ion selectivity in potassium-selective channelrhodopsins 加藤英明さんラボ出てもらった時のエピソード HcKCRを最初に報告した論文 WiChRプレプリント（Sci. Adv. in press） ChRmineの論文加藤さんのNat Comm

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03:02:23

#49 Memento Mori

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2022/10/24

ゲスト回ラッシュの振り返り、感染フラグ、前向性健忘に関する雑談。フラッシュ論文紹介は、皮質と海馬のタスクルール表象の違い、内在mRNA依存的な外来mRNA翻訳制御法、方位選択性コラムの起源示唆、マイクログリア用AAV、実験メタデータ管理、１分子プロテインシーケンシング、等(10/15収録) Show Notes: Eve Marderの新作 The Complement Sandwich 感染した場合は180日後くらいの方が抗体価上がる ASCONA meeting アメリカ政権のオープンアクセスMandatory AAASのプレプリントに対するポリシー DIANA論文 Abema Primeのひろゆき全推し回、YouTube Mさん（Henry Molaison）について、ラリースクアイアによる追悼記事 Henry Molaisonは海馬じゃなくてエントライナルが飛んでたメメント論文１・Samborska et al., Complementary task representations in hippocampus and prefrontal

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01:31:37

#48 In search of thalamo-cortical computational...

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2022/10/17

We sat down with Lukas Ian Schmitt (@lucidianS), a team leader at RIKEN CBS, and talked about his trajectory, life in Japan, past and ongoing projects about the distributed computation in the cortico-thalamic loop, and related works (Recorded on 9/10) Show Notes: Ian’s lab at RIKEN: Laboratory for Distributed Cognitive Processing Miho: Miho Nakajima-san Mike Halassa’s lab @NYU->MIT Phil Haydon’s lab @Tufts The Neuron by Kaczmarek (and Levitan)(Still have the original on my shelf here. –

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02:47:29

#47 On flexibility in cognitive processes, behavioral...

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2022/10/10

理研CBSの中島美保さん（@mihonakajima）がゲスト。大学院時代とポスドク時代の仕事の背景、それらを踏まえたCell Typeに関する議論、特定の高次機能を問うためのTailor-made行動試験の作り方、などを伺いました (8/17, 9/10 収録) Show Notes: 認知分散処理研究チームHP 中島さん業績集 Nat Heintzラボオキシトシンに反応するmPFCニューロンのメス性行動への影響…のお仕事 BAC Tgの基礎を作ったHeintzたちの仕事 in 1997 BAC トランスジェニックの神経科学への応用を解説した2001年のレビュー Michael Halassaラボ Halassaラボでの注意機能による感覚選択を司る脳回路、のお仕事その自閉症モデルでの状態と緩和方法探索、のお仕事イアン・シュミット GENSATの論文 TRAP ：ここではTranslating Ribosome Affinity Purification (TRAP) のこと。その１その２ Parafascicular nucleus:

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02:37:06

#46 The Fos expression we saw that day

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2022/10/07

ゲスト参加型のJournal Club。海馬CA1ニューロンにおけるFos発現と場所表象・神経活動の双方的な関係を調べた論文を題材に、北西卓磨さん(@tkitanishi)、吉良信一郎さん(@ShinichiroKira)、田中和正さん(@Kazu_ZT)、柳下祥さん(@sho_yagishita) とディスカッションをしました。(9/22 収録) Show Notes(完全版): お題の論文：Fos ensembles encode and shape stable spatial maps in the hippocampus 田中さん NR田中さん回北西さん NR北西さん回 Part1 Part2 柳下さん吉良さん Harveyラボ Greenbergラボ田中さんのトムラボでの論文 Thomas McHugh よく使われるcFos-tTA, Mayfordの作ったライン *knock-inと言ってますがtgです(萩) の元論文最初の利根川研での仕事 Fig1fgでshGFPがまあまあ綺麗に見えている

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03:21:09

#45 The amyloid hypothesis of Alzheimer's disease,...

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2022/10/03

認知症研究者の佐野俊春さん（@tsano321）に、アルツハイマー型認知症のAβ仮説の歴史と論拠、最近の基礎研究・臨床試験の動向、今後の展望について教えていただきました（9/3収録） Show Notes (完全版): 佐野さんタンパク質構造疾患研究チーム岩坪研 PhD時代の仕事（の一部）博士論文の要旨神経変性疾患のプリオン様伝播仮説生活習慣病と認知症のレビュー by 佐野さん Aβの治験が上手くいかない：Aβを標的とする抗体医薬の治験失敗が続く中で2018年に出たコメンタリー抗Aβ抗体医薬が効かない原因の考察を含むSelkoe達によるAβ仮説レビュー Aβ*56捏造疑惑に関する記事 Aβ*56捏造疑惑が出た時のAlzforumの反応 Aβオリゴマーが神経細胞毒性を有する富田先生によるアルツハイマー病の歴史の表 1984年アルツハイマー病患者の脳内の血管壁に沈着したAmyloid βを単離老人斑の主要構成成分はAmyloid β 1987年 APPのクローニング 1992にamyloid cascade

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02:00:32

#44 Timestamping academic life events onto podcast...

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2022/09/22

帰ってきた北沢太郎さん(@kitazawa_taro) 。これから参入するEngram業界の学会@ダブリンの印象、そしてDANDRITEでのラボ立ち上げから一カ月が経過した現在の状況。特にリクルーティング、ヨーロッパ・デンマークのファンディング事情、人的ネットワーク作りなど（9/18収録） Show Notes: 北沢さんラボ北沢さん前回収録その１その２ DANDRITE Engram 学会 CaMPARI2 GeorgがV1ミスマッチでやったよね、という話をするのを忘れた(萩) Greenberg とHarveyのNature Johannes Graff 僕の論文 ERC Christine Denny がArcプッシュ Arcのviral transmission Greenberg LinのScienceは2011でした FosとArcを比べたCell 活動との相関性 Npas4-”FH”はFlag-HAのknock-inで、免疫染色しやすいライン。 Yap et al. FosKOの表現型

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02:34:20

#43 Splendid isolation

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2022/08/08

伏線回収、円安・オイル高騰中の海外生活・学会参加に関する雑談など。後半は、SNcドパミン神経の細胞体と軸索＠線条体の活動をサブタイプ毎に観察した仕事、カリウム選択的なチャネルロドプシンに関する論文×２、Eve Marderのエッセイを元にしたディスカッション（7/16収録） Show Notes: コロナ中に収録したエピソードその１その２ Mark Anderman のパートナー、Maria Lehtinen David Kleinfeld 細胞そのものがセンサー(CNiFERs) Dombeckラボ Awatramaniラボ論文１：Dopaminergic axons track somatic signaling in behaving mice Joshua Berke のラボから出ていたVTAの細胞体とNAcドパミンのdissociation アセチルコリンがドパミンの軸索でAction Potentialを起こす Amatramaniラボからの前報で、SNcドパミンの形態を細胞種毎にキャラクタライズした仕事 Dombeck は

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