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PODCAST

NeuroRadio

米国シアトル・ボストン在住の神経科学者2人によるポッドキャスト。最新の研究論文紹介や基礎科学・医学研究に関する(あるいは全く関係しない)雑談、留学情報など。感想やコメント、質問などはtwitterハッシュタグ #NeuroRadio あるいはinfoあっとneuroradio.tokyoまで。

science life sciences

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01:06:28

#22 Artificial/Artifactual neural manipulations

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2021/09/08

印象に残っている歴史上の研究者、総説のライティング、オプトジェネティクスのアーティファクトを取り扱った論文等について話しました (9/5収録) Shownotes: UC irvineの場所 The OC Breaking Bad Good Will Hunting ボストンアクセント（を揶揄した動画） Nirvana Nevermindの赤ちゃん、訴えるエヴァ＠Amazon Prime ダーシー・トムソンチャールズ・シェリントン細胞説のフィルヒョーロベルト・コッホペンフィールドエクルス Proprioception Man on his nature Liqunの総説 Kay Tyeの総説 Mrsic-Flogelの総説 eOPN3論文論文１：Mathias Mahnが昔出していたアーティファクト論文 Bruchasの方の論文（Neuronでした） Scott SternsonのhM4D+nrxnによるpresynapse抑制 OferのGtACR2論文

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01:27:37

#21 A programmed round-trip for Europe by Dr. Keisuke...

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2021/08/13

Part 1に引き続き、DANDRITE＆遺伝研（10月から）の米原圭祐さん(@K_Reisfeld)にお越しいただき、欧州のスタートアップグラント事情、ポスドク時代に欧州からのジョブハントで苦労したこと、今回Neuronにアクセプトされた双極細胞の軸索末端におけるsubcellular computation論文の内容紹介,、遺伝研でのこれからの研究の方向性について伺いました（7/10収録） Shownotes: エイミーノエタ：Emmy-Noether-Programme 欧州のグラントの特徴まとめ、たとえばこういうの (直pdf.注意) Dandrite DirectorのPoul Nissen Jens Skou オーフスにいる竹内さん Stadtman Investigator Max Plank Neurobiology Nadine Gogolla Ruben Portugues エミリー：Emilie Macé トーマス：Thomas Frank 2013年のNeuron K99 遺伝研の宿舎

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01:38:01

#20 A programmed round-trip for Europe by Dr. Keisuke...

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2021/08/13

デンマーク、オーフス大学DANDRITE研究所＆遺伝研（10月から）の米原圭祐さん(@K_Reisfeld)にお越しいただき、これまでのキャリアと、海外と日本でJunior PIをやることの比較、Junior PIとして地位を確立する際に苦労したこと、等をお話しいただきました（7/10収録） Shownotes: 神経科学ニュース（直.pdf注意）基礎生物学研究所/修了生の声 DANDRITEでチームリーダーを始めた頃最近のもの。EMBLで受けた影響等米原ラボHP In pressの論文 Neuron版 bioRxiv版基礎生物学研究所（基生研）野田先生HP (現在のラボHP@東工大特任教授) Botond Roska（現在はIOBディレクター）北欧EMBL（パートナーシップ）：北欧の主要な大学に設立されたEuropean Molecular Biology Laboratory のスタイルで運営される研究機関のネットワーク Natureの論文ライフサイエンス新着論文レビュー博士課程にいた時に見つけたマウス論文その１その２ Starburst

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02:15:47

#19 Tangled Up in the Brain/Reality

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2021/08/10

それぞれの近況、作品と作り手の分離、Caイメージングとコネクトームの対応データとそのビューワー、迷路を走るマウス、Self-inactivating Rabiesをめぐるゴタゴタ等について話しました。 Shownotes: AlphaFold2 論文 Graph Neural Networkの勉強：こういうの bioRxivに上がってた仕事神経科学会の"Fear Mechanism"シンポジウム(追ってオンデマンド配信のリンク足します) 来年の神経科学会(@沖縄) マサチューセッツのクラスターイスラエルの政府レポート…はヘブライ語なのでWSJによる解説記事星座の名前になるかもアメリカは政策で太ったみたいな話　この番組の How America Is Causing Global Obesity回映画業界の#MeToo関連の話（Kevin Spaceyの場合）ワトソンやばい話 (ちなみにCSHLのPhDプログラムは去年をもってWatson Schoolの名前を廃止していた) Kandel本 Thom Jossellやばい

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02:31:37

#18 Fine viral description – tracing the career of...

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2021/07/16

理研BDRの宮道和成さん（@K_Miyamichi）にお越しいただき、キャリア選択時に考えていたこと、現在の研究の魅力、新機軸の打ち出し方、子育てに伴う研究スタイルのシフト、等をお話しいただきました（7/3収録） Shownotes: 宮道さん過去のインタビュー：神経科学ニュース（直.pdf注意）　理研BDRタイムズ科学道比較コネクトミクス研究チームHP 立花隆の脳を究める森憲作先生によるウサギ電気生理このあたり Linda BuckとRichard Axelによる1991年の嗅覚受容体報告論文嗅覚受容体の発現パターンの研究：１嗅神経１嗅覚受容体を実現するネガティブフィードバックの研究嗅上皮の中で嗅覚受容体がどのように並び、嗅球に行った時にどのように展開するか、の研究ガイダンスモルキュールをいじったときにどう変わるか…の研究の例 1 2 Liqun LuoラボHP MARCM論文 MADMのCell論文 Callaway の2007年(Wickersham et al) モノシナプストレーシング論文 NeuronのPrimer

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01:45:58

#17 The same inputs, different outputs

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2021/07/02

ラボミーティング・研究所内セミナー形式についての雑談、フラッシュ論文紹介:海馬における空間・evidence表象、同一の刺激に対する神経活動の揺らぎに関する議論など（6/28収録） Show notes: QRコードによる接種証明 (いわゆるデジタルワクチンパス) UK上がっている G7近くのホテルが閉まる若手中堅の研究会 (7/9) *世話人を介した登録が必要生理研の研究会一覧：多様な視点から情動を捉え直す情動研究会(9/15), 記憶・学習の多角的理解に向けたアプローチ(9/16) 今年は現地とZoomのハイブリッド開催。北西部がおかしいボストンの気候フラッシュ論文紹介宮脇論文その１：Geometry of abstract learned knowledge in the hippocampus Aronovのnon-spatial mapping論文 Harveyのparietal cortex論文 bioRxiv に上がってるCortexの方の論文論文その２：Disrupted social memory

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02:02:00

#16 Mechanistic vs population codes – Inter-show...

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2021/06/28

理研風間研・研エンの仲ポッドキャスターの加藤郁佳さん（@kayautoka）をゲストに、これまでのキャリア、モデル動物選択、これからポスドク先を選ぶにあたっての悩みなどを共有して頂きました。(6/6収録) Show notes: 加藤さん Researchmap 個人HP データベースCPSYMAP：「どの病気のどういう症状に数理モデルがあって、逆にどういうところが欠けているのか」を可視化する、計算論的精神医学のデータベースプレスリリース知覚神経回路機構研究チーム（風間研）日常生活の最適化EP：前編後編 STUTSくん：平成生まれのトラックメーカー長岡亮介（aka 浮雲、忘るまじおじさん）：最近は星野源などのサポートに大活躍。東京事変の2代目ギタリストでもある。 Kording論文EP 元ネタ：Could a Neuroscientist Understand a Microprocessor? HCI: Human Computer Interfaceのこと留学関係の所で喋った:海外大学院説明会youtube（53:10-から）

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01:52:12

#15 Dual-career at Stanford: Dr. Sayaka Inoue and Dr....

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2021/06/18

前回に引き続き、井上夫妻 (@feynman1104 , @s_k_inoue ) をゲストに、これまでとこれからのキャリア、ポスドクのお金事情、アメリカでの子育て、生活tips等について伺いました。（5/28収録） Show notes: Tom Mrsic-FlogelとSonja Hofer：UCLのSainsbury Welcome Centreで共にPIをしている夫妻研究者 Michell Monje：神経活動とグリオーマの増悪の関連などを研究カールの会社：ClearLight Biotechnologies（CLARITY関連）、MapLight（オプト関連） Inscopix：自由行動下の動物に適用可能な小型顕微鏡を開発している会社 (Schnitzer研のスピンオフ) ベネフィット：福利厚生 J1ビザ：交流訪問者プログラム用のビザ。海外学振などで日本のフェローシップをベースに、日本に帰る前提（建前で良い）でアメリカに行く時はこれ。

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01:16:48

#14 Dual-career at Stanford: Dr. Sayaka Inoue and Dr....

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2021/06/11

日本神経科学会の奨励賞を夫妻でそれぞれ受賞した井上昌俊さん（まささん）@feynman1104・井上清香さん（さやかさん）@s_k_inoueをゲストに、お二人の論文の裏話、スタンフォード大学で神経科学を研究する醍醐味などについて伺いました。後半に続きます。（5/28収録） Show notes: 奨励賞リンク Axon Remodelingのお仕事：メスの視床下部腹内側部のプロゲステロン受容体陽性細胞(Progesterone receptor expressing neurons in the ventrolateral portion of the ventromedial hypothalamus: Pvlニューロン)の前腹側室周囲核(Anteroventral periventricular nucleus: AVPV)への投射量が性周期（依存的な性ホルモンの分泌）によって変化することを見出した仕事。AVPVに繋がっている時にPvlが活動することがオスの受け入れに重要。プレシナプス・軸索の大規模な構造的変化が大人で周期的に起こる可能性を示唆。

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01:49:07

#13 Non-stealth marketing – the inaugural 1st author...

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2021/05/26

扁桃体Intercalted clusters (ITC) の亜核ITCdm/ITCvm (背側核/腹側核)が真逆の機能を持つこと、相互抑制の回路モチーフを持つこと、異なる投射先を協調制御していること等を報告した自身の最近の仕事について、萩原が裏話も交えながら紹介。 Shoe notes: Intercalated amygdala clusters orchestrate a switch in fear state 神経科学トピックス...日本語の解説記事@神経科学学会 Andreas Lüthiラボ Lüthiラボからの扁桃体回路レビュー（2015年） Pareの仕事↓ オピオイド受容体の発現を利用した毒素によってITCを破壊した仕事 ITCがBLA->CeAのImpulseを制御しているというgating仮説スライスでExtinctionに相関した可塑性を見つけた天野さんの仕事奇跡的にITCからvivoで電気記録を行なった仕事 Fear Conditioning(恐怖学習)の用語補足↓ CS: conditioned

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00:29:45

#12 Retrospection on Retroinfection

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2021/05/24

前回の補足も兼ねて、Pseudo-typed Rabies Virusの原理と、その開発の歴史、今後の展望について萩原がサクッと解説。（5/22収録） Show notes: G-deleted rabies virus の開発・応用の第一人者であるEd CallawayとLiqun Luoによるレビュー論文。今回の企画は主にこの総説に沿って話しています。ミルウォーキープロトコル(wiki) 。n=1と言ってますが、その後改良版が試され、これまで6人助かってるようです(n~50)。獣医学会のコラムが興味深い:狂犬病を発病した患者の最初の回復例小坂田さん...Callaway研でRabiesのvariant作成論文を書かれて、世界中でリソースが使われて共同研究をされている。現・名古屋大。 AnteroにトブHSVを使ったAndermannの仕事。Hypothal->PVT->BLA->Insular経路の証明。HSV(H129ΔTK)自体はDJAが開発。最初のG-deleted Rabies開発論文。Wickersham/Callaway. 2007a

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02:01:51

#11 Sequencing the Connectome

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2021/05/21

シーケンシングによって(神経)細胞の繋がり方・投射様式を調べる方法について。Zadorラボから報告されているMAPseq等の手法を一通りおさらいした後、Quintanaラボから報告されたRABID-seq論文を紹介。(収録:5/15) Show notes: RABID-seq: Barcoded viral tracing of single-cell interactions in central nervous system inflammation MAPseq論文: High-Throughput Mapping of Single-Neuron Projections by Sequencing of Barcoded RNA BRICseq論文: BRICseq Bridges Brain-wide Interregional Connectivity to Neural Activity and Gene Expression in Single Animals BARseq論文: High-Throughput Mapping of Long-Range

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02:06:05

#10 Retrospection of Engrams

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2021/04/30

ゲスト回を振り返ってEngramについて雑談したり、最近目にした面白い論文をフラッシュトーク的に紹介しあったりしました。(収録:4/24) Show Notes: 冒頭雑談 ( - 0:26:25) 変異株に対するワクチンの有効性、論文プロテアーゼを一緒に打ち込む: この論文 Nature Medicineでしたマシュマロ: 誹謗中傷を自動で除外する匿名コメント機能 (4/29- 受け付けてます!) エングラム雑談 (0:26:35 - ) Sheena Josselyn: 扁桃体等をモデルに記憶を担う細胞について研究。CREB関連の仕事が有名 Richard Semon (1859-1918): 動物学者・進化生物学者。エングラムの存在を予想。 Josselyn/Tonegawaによる総まとめ的総説決定版:Memory engrams: Recalling the past and imagining the future ジフ: 最初期遺伝子の一つ、Zif-268のこと All Optical Physiology:

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01:24:15

#9 Social Interaction with Dr. Teruhiro Okuyama – Part 2

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2021/04/28

奥山輝大さん（@Teru_Okuyama）ゲスト回後編。メダカ論文の裏話、利根川進先生と一緒に研究をすること、LOF/GOF一辺倒の研究に対して思うこと、などをお話しいただきました。 Show Notes: もうまんたい…ナインティナイン岡村主演の映画、無問題 (1999年) やくさく…池谷先生が主宰する研究室、薬品作用学教室（薬作）のこと（大学院時代の）大ボス…久保健雄先生のこと武田研…武田洋幸先生のラボのこと Adult Neurogenesis…生体脳でのニューロン新生。神経幹細胞がニューロンに分化するのは（主に）胎生期から幼年期のみであるが、齧歯類等では、生体脳においても脳室下帯や海馬歯状回で神経新生が起こり、既存の回路に組み込まれる。この機能的意義が2000年頃から報告され始め、2010年頃に盛んに研究されていた。レビューはこちら Paul…神経新生の記憶への関与や、遠隔記憶、CREBなどの研究で有名なトロントのPaul Franklandのこと。Sheena Josselynの夫でもある。アルバレスブイリヤ…UCSFで神経新生をやっているArturo

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01:03:06

#8 Social Interaction with Dr. Teruhiro Okuyama – Part 1

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2021/04/21

東大定量研の奥山輝大さん（@Teru_Okuyama）をゲストに迎え、大学院時代、ポスドク時代、キャリア選択の際に考えていたこと、新PIとしての３年間についてお話しいただきました。後編(Part2)に続きます。 Show Notes: 奥山ラボHP バイリンガルニュース定量研…東京大学の附置研、定量生命科学研究所のこと。メダカの性行動の論文…A Neural Mechanism Underlying Mating Preferences for Familiar Individuals in Medaka Fish

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01:58:20

#7 Fireside Chat with Dr. Kazumasa Z. Tanaka

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2021/04/09

OISTの田中和正さん（@Kazu_ZT）をゲストにお招きし、OISTの研究環境、新PIのラボ運営、これからの研究方針、過去の研究の裏話などについて伺いました Show notes: 脳のハードドライブの仕組みと理由を探る...田中さんのインタビュー記事田中さんのラボHP Cortical representations are reinstated by the hippocampus during memory retrieval …田中さんの大学院時代の業績。Neuron論文。fos-tTA, tetO-H2B-GFP, tetO-Creの３重トランスジェニックマウスのCA1に、Cre依存的に機能するArchTをAAVにより導入。文脈的恐怖条件づけの想起時に海馬CA1のfos陽性細胞を抑制すると、海馬外の領域（皮質・海馬台・偏桃体など）において、記憶の獲得時にfosプロモーターが動いていた細胞と想起時にcFosを発現する細胞のオーバーラップ率が低下することを示した。 The hippocampal engram maps experience but not

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00:31:40

#6 You can (not) watch the movie

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2021/03/30

雑談回。エヴァ(観てない)、シン・ゴジラ、ボストンの海鮮、ワクチン、ヘイトクライム等について。 Show Notes: Evangelion 3.0+1.0 Thrice Upon A Time...本当に見たい鷺巣詩郎...エヴァの音楽作ってる人。さぎすしろう。巨神兵東京に現わる...庵野監督による特撮作品 Union Oyster House...ボストンのシーフードの老舗 Legal Sea Foods...村上春樹もよく行っている(た)というシーフード店。(「ラオスにいったい何があるんですか？」に収録) アストラゼネカ製ワクチンと血栓症には因果関係は認められず、リスクがメリットを上回るため基本的には継続使用を推奨するというWHOのレポート。(*3/20時点での情報なので最新の情報にアクセスするようにしてください) Associations of the BNT162b2 COVID-19 vaccine effectiveness with patient age and

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00:57:39

#5 Mapping the spatial transcriptomics

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2021/03/30

10000種類以上のmRNAをsubcellular resolutionで解析できそうなSpatial transcriptomicsの手法について、５つの原理に分けて簡単にレビュー。 Show Notes: 1. RNAのcDNAを環状にして増幅、SOLiDでin situ sequencing Highly Multiplexed Subcellular RNA Sequencing in Situ...FISSEQ。George Churchラボ。 Rolling Circle Amplification...環状にした一本鎖DNAテンプレートに対して一方向にポリメラーゼで増幅をかけ、何周もさせることにより、巨大なアンプリコンを作成する手法 Next Gen SOLiD DNA Sequencing Method Explained...SOLiDの原理説明動画。In Situ Sequencingの文脈で関連があるのは 5:18~。 Expansion sequencing: Spatially precise in situ transcriptomics in

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01:14:14

#4 What is cell-type? – Transcriptome meets...

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2021/03/24

ニューロンの細胞種はどう定義されるのか？萩原が in vivo Caイメージングとspatial transcriptomicsを組み合わせた研究２報を紹介しながら議論。トランスクリプトーム回の前編。 Show Notes: ・Dense Functional and Molecular Readout of a Circuit Hub in Sensory Cortex...今回メインで話題にした論文その１。CRACK: Comprehensive Readout of Activity and Cell Type Markers. (Jerry Chenラボ) ・Behavioral state coding by molecularly defined paraventricular hypothalamic cell type ensembles...今回メインで話題にした論文その２。CaRMA: Calcium and RNA multiplexed activity (Scott Sternsonラボ) ・Allen Institute for Brain

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00:27:52

#3 Covid19 dominates everything

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2021/03/08

パンデミックの影響に関して雑談。ヨーロッパでロックダウンの影響をもろに受けた萩原と、パンデミック下にオンラインポスドクインタビュー・ボストン留学開始を経験した宮脇がそれぞれ雑感を話しています。 Show notes: Salary Cap, Stipends, & Training Funds...米ポスドクの賃金目安 OIST...沖縄科学技術大学院大学のこと Maruichi...ボストンの日本食材スーパー Editorial notes: 早くワクチンが行き届いて、少しでも早く以前の日常に近い日々が戻るといいのですが。ちなみにinterviewをしたのは2019年ではなく、2020年1月の間違い...。萩原リポフェクションやアデノウイルスの打ち込み、される側になるとは思ってもみませんでした。宮脇

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