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腸内細菌相談室

【腸から自分と世界を知る】 #腸内細菌や#腸内環境について論文を根拠にお話しする腸内細菌相談室。毎週金曜夜19:30にPodcastでお会いしましょう🎙️質問、リクエストはXまで！当番組の活動に御賛同頂けるスポンサーを募集中 (XアカウントのDMよりお待ちしております) ウェブサイト： https://chonaisoudan.com/

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00:12:25

#264【種同定の基礎】ショットガンメタゲノムシーケンシングによる腸内細菌叢の調査。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/20

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、ショットガンメタゲノムシーケンシングによる腸内細菌叢の種同定についてお話しました。 16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンシングとの比較も含めてお話していきます！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:16:35

#263【種同定の基礎】16s rRNA遺伝子アンプリコンシーケンシングによる腸内細菌叢の調査。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/19

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、腸内細菌叢の具体的な解析手法として、16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンシングによる腸内細菌叢の解析についてお話します！紹介した解析パイプラインの順序は、バイオインフォマティクスの教科書に記載されています：https://www.kspub.co.jp/book/detail/5138212.html ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:08:37

#262【種同定の基礎】配列データベースまとめ。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/18

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、今日の腸内細菌研究には欠かせないデータベースについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:11:29

#261【種同定の基礎】塩基配列の相同性検索。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/17

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、塩基配列を用いた種同定で欠かせない相同性検索について、大まかな流れとBLASTについてお話しました！国立遺伝学研究所, 相同性検索プログラムBLASTの内部構造: https://www.ddbj.nig.ac.jp/activities/blast-doc.html 奈良先端大, ペアワイズアライメントと配列相同性解析配列相同性解析: http://isw3.naist.jp/IS/Kawabata-lab/LECDOC_KINDAI/2010/alignment_10Apr20_print.pdf BLAST論文：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2231712/ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:19:35

#260【種同定の基礎】種と塩基配列。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/16

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、細菌の種分類と塩基配列の関係として、DNA-DNAハイブリダイゼーション、16S rRNA遺伝子、マーカー遺伝子、ANIの観点からお話しました！今日の内容はちょいムズです！ ANI vs DDHの関係論文①： https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.0409727102#body-ref-ref25 ANI vs DDHの関係論文②：https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijs.0.64483-0 ANI vs DDHの関係論文③：https://www.nature.com/articles/s41467-018-07641-9 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:14:35

#259【種同定の基礎】種とは何かを考える。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/15

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今週より、種同定の基礎と題して、腸内細菌の種を決定する方法についてお話します。まずは、種とは何かから一緒に考えてみましょう。 Oxford: Leaner's Dictionaries: https://www.oxfordlearnersdictionaries.com/definition/english/species 筑波大学八畑先生教員紹介の記事：https://cbs.biol.tsukuba.ac.jp/update/398 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:14:42

#258 【配列決定の基礎】配列のクオリティコントロール

腸内細菌相談室 ·

2023/05/14

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、配列決定後のクオリティコントロールについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:19:56

#257【配列決定の基礎】塩基配列の決定技術。サンガー法からIllumina、PacBio、Oxford...

腸内細菌相談室 ·

2023/05/13

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、配列決定の技術として各社が提供するシーケンシング技術について概観しました。 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:21:57

#256【配列決定の基礎】蛍光と配列決定

腸内細菌相談室 ·

2023/05/12

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、蛍光と配列決定についてお話しました！蛍光とは何かからお話していきます！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:12:58

#255【配列決定の基礎】PCRの原理

腸内細菌相談室 ·

2023/05/11

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、配列決定の基礎であるPCRの原理についてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:28:35

#254【科学系ポッドキャストの日】論文の構造と目的別読み方

腸内細菌相談室 ·

2023/05/10

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。毎月10日は科学系ポッドキャストの日！今月のテーマは「論文」ということで、腸内細菌相談室では「論文の構造と目的別読み方」についてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:10:55

#253 【配列決定の基礎】塩基配列が生物の個性を決める。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/09

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードでは、セントラル・ドグマや遺伝のお話を通して、「塩基配列が生物の個性を決める。」というお話をしました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:17:56

#252 【配列決定の基礎】塩基配列とは何か？

腸内細菌相談室 ·

2023/05/08

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。突然ですが質問です。お腹の中の腸内細菌叢はどのようにして知ることが出来るのでしょうか？この質問に答えるべく、今週は配列決定の基礎、来週は種同定の基礎と題してお話をしていきます。今回のエピソードでは、塩基配列とは何かについてお話しました！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:16:53

#251 糞便微生物移植による腸内細菌叢の変化をモデルにより予測できるか？

腸内細菌相談室 ·

2023/05/07

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードは、今週のテーマである糞便微生物移植のお話の締めくくりとして、糞便微生物移植により変化する腸内細菌叢を316例について解析したメタアナリシスの研究をご紹介します！原著論文：https://www.nature.com/articles/s41591-022-01913-0 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:09:41

#250 腸内細菌相談室とは？

腸内細菌相談室 ·

2023/05/06

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回のエピソードは、第250回記念！いつも聴いてくださっているリスナー、最近聴き始めたリスナーの方に向けてお話をしました！これからも、一緒に腸内細菌、腸内環境について楽しく学んで行きましょう！ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:10:00

#249 アメリカの非営利団体OpenBiomeが提供する便バンク。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/05

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回は、糞便微生物移植用の便バンクを提供するアメリカの非営利団体、OpenBiomeの活動についてご紹介します。 OpenBiomeのメソッドを共有した論文：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2021.622949/full ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:12:00

#248 糞便微生物移植の手順。アムステルダムプロトコルについて。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/04

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回は、糞便微生物移植の手順として2013年に定められたアムステルダムプロトコルについてお話します！アムステルダムプロトコルの論文：https://doi.org/10.1053/j.gastro.2013.08.058 ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:09:19

#247 腸内細菌叢のバイオ医薬品Rebyota®が米国FDAの承認を取得。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/03

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回は、2022年11月30日に米国FDAの承認を受けたバイオ医薬品で、糞便微生物由来のRebyota®についてお話しました！プレスリリース：https://d2gohj824v350l.cloudfront.net/wp-content/uploads/sites/32/2022/12/08211836/20221209_pressrelease.pdf Rebyota®の仕様：https://ferringus2.corporate-us.ferring.tech/wp-content/uploads/sites/12/2022/12/9009000002_REBYOTA-PI_11-2022.pdf ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:12:22

#246...

腸内細菌相談室 ·

2023/05/02

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今回は、2023年1月より先進医療Bに承認された抗菌剤併用の糞便微生物移植についてお話します！保険適用に向けて糞便微生物移植の実施が国内でもスタート！潰瘍性大腸炎患者のリスナーに届け！先進医療承認、順天堂リリース：https://www.juntendo.ac.jp/news/00311.html 潰瘍性大腸炎患者、便ドナーの募集：https://hosp.juntendo.ac.jp/clinic/department/shokaki/about/gastrointestinal/intestinal_microbiota1.html ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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00:13:56

#245 糞便微生物移植の概要。メリットとデメリット。

腸内細菌相談室 ·

2023/05/01

腸内細菌相談室の鈴木大輔です。今週は、最近話題の糞便微生物移植について、深堀していきます！今回のエピソードでは、糞便微生物移植の概要と、メリット、デメリットについてお話します！アムステルダム大学の研究：https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/nejmoa1205037 FMTの有害事象に関するメタアナリシス：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8922263/ ================================= 提供：メタジェンセラピューティクス株式会社メタジェンセラピューティクスは、腸内細菌を必要な患者さんに届ける「腸内細菌叢バンク」という仕組みを作るために、2023年4月20日 (木)～6月16日 (金)

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